可以说，色谱柱是色谱分析过程中最重要的部分，相当于人体的“心脏”。根据自己要分析的样品去选择合适的液相色谱柱，需要考虑不同参数将会造成什么影响，比如粒径、酸碱性、极性和分子量大小等。即使是液相色谱柱也分很多类型，比如正相、反相、C18柱、亲水性色谱柱等等。只有了解影响分析柱性能的因素，才能结合目标分析物的性质、需要达到的分析效果及实验室条件来选择适合的色谱柱。
在设定选择样品分析的HPLC方法时，首先需要根据化合物的分子量大小，极性大小等因素选择合适的分离模式，在适当的分离模式下去选择合适的色谱柱及流动相。在很多色谱分析中涉及的化合物样品绝大部分都可以使用反相分离模式，恒谱生有许多可用于反相分离的液相分析柱，比如USHA C18、USHA C8、USHA C4、USHA苯基柱、USHA氰基柱等。
影响反相键合相色谱柱性能的因素有哪些呢？
一、硅胶纯度
硅胶纯度对峰形有很大液相，硅胶杂质和残留的金属离子会影响样品的峰形，如果硅胶表面的金属含量高会影响碱性化合物的峰形，易发生拖尾。恒谱生USHAC18色谱柱以全覆盖的键合硅胶为填料，具有优异的稳定性、重复性、高选择性和高分离度等特点。
二、颗粒形状及粒径
球形颗粒柱效高、重现性好、柱床结构均匀；不规则的颗粒柱床结构不均匀、流动相线速度不均匀，容易形成谱带展宽；平均颗粒直径，粒径越小，柱效越高，柱压也越高。粒径分布越广则柱效越低，压力越大。恒谱生色谱填料均采用球形形状，列如USHB Sil色谱柱采用高纯度球形硅胶，金属杂质＜10ppm，具有柱效高和峰形好等特点，可用于分离极性和碱性的有机化合物。
三、颗粒表面积
相对而言，高表面积对样品具有较强的保留能力，更大的柱容量和分离度。而低表面积能更快达到平衡状态，更适合梯度洗脱程序。
除了以上这些因素，还有诸如键合类型及键合相、碳覆盖率等因素影响。单体键合方式可以提高传质速率，缩短柱平衡时间；聚合体键合方式可以增加色谱柱稳定性，增加载样量。键合相的不同会直接影响化合物的保留行为。而高碳覆盖率可以提高分辨率和重现性，但分析时间长。
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